Conformément aux dispositions de l'article 19 de son statut, on a élu le 29 Mai 2016, le premier comité directeur de l'aquarium pour la période 2016-2020 et il a été convenu de répartir les tâches entre les membres de ce comité comme sous indiqué :
- Mr Ben Rejeb Mounir : Président
- Mr Bouchoucha Mohamed Bécim : Premier Vice Président
- Mr Abdennadher Tej : Secrétaire Général
- Mr Sanchou Houssemiddine : Trésorier
- Mme Akremi Haifa : Trésorier Adjoint
- Mr Riahi Mohamed : Secrétaire Général Adjoint
- Mr Jaouadi Mohaméd : Deuxième Vice Président chargé de la communication.