Le conseil d'administration de l'hôpital Habib Thameur de Tunis est constitué des membres suivants :
1) Monsieur Hichem Mekkaoui : représentant du ministère des finances
2) Monsieur Chadly Souayah : représentant du ministère du plan et du développement régional
3) docteur Raouf Ben Ammar : représentant du ministère des affaires sociales
4) docteur Salaheddine Balti : représentant du ministère de la santé publique
5) docteur Lilia Rokbani : président du comité médical
6) docteur Abdelhafidh Kraiem : médecin chef de service
7) docteur Mohamed Lotfi Slimane : médecin chef de service
8) docteur Sadok Sayed : médecin chef de service
9) docteur Abderraouf Chérif : représentant des médecins maîtres de conférence agrégés et des médecins des hôpitaux exerçant au sein de l'hôpital
10) docteur Najet Bel Hadj Brik : représentant des médecins assistants hospitalo-universitaires exerçant au sein de l'hôpital
11) Madame Najoua Kaddour : pharmacienne
12) docteur Abderrahmane Ladgham : représentant du doyen de la faculté de médecine de Tunis
13) docteur Hachmi Ayari : représentant des médecins de libre pratique
14) Monsieur Mohamed Tahar Hachani : représentant du corps paramédical exerçant au sein de l'hôpital
15) docteur Hatem Hamzaoui : représentant de la commune de Tunis
16) Monsieur M'hamed El Gharbi : représentant des usagers.
Le conseil d'administration de l'hôpital Habib Thameur est présidé par le Docteur Slaheddine Balti.